第96代天皇、大覚寺統の系統。および南朝初代天皇。在位1318年-1339年。諱（いみな、本名）は、尊治（たかはる）です。皇位継承に口出ししてくる鎌倉幕府の打倒に燃え、二度のクーデター計画が露見して、隠岐島に流されるも、鎌倉幕府に対する抵抗運動は収まらずに、鎌倉幕府の打倒に成功。建武の新政と言われる、醍醐天皇の延喜の治を理想とした天皇親政を目指しますが、皇族・貴族と一部の有力武士しか大切にされない政治であったため、「なんだよ。鎌倉幕府の方がマシだったじゃないか」と思われてしまいます。新しい武家政治のトップとして、足利尊氏に対する声望が高まり、尊氏を抑え込もうとしますが失敗。尊氏は大覚寺統と対立している持明院統の光明天皇を担ぎあげます。後醍醐天皇は吉野に脱出し、ここに天皇が二人いる南北朝時代が始まったのでした。後醍醐天皇は、京都奪還を夢見たまま亡くなりますが、死に際して自分が理想とした醍醐天皇の後継者として、尊号を「後醍醐」とすることと、自分の墓の向きを北（吉野からみて、京都の方角）にし、そして、京都奪回を諦めるなと遺言して亡くなりました。